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编程开发>> 高性能计算>> Amira
 
产品名称:Amira
开发公司:VSG
当前版本:5.4
 
 
产品介绍:Amira
Amira
专为生命科学方面设计的三维分析软件

Amira 是一个强大的多面向的三维软件平台,用于可视化、操控及帮助理解分析生物医学数据,这些数据可以是来自各种类型的资源和方式。Amira最初在显微镜和生物医学研究领域作为一个三维可视化工具而被广泛的使用,现在它在生命科学领域已经成为一个越来越尖端的产品,在可视化仿真技术方面提供强大的可视化和分析能力。

如何选择适合您的Amira模块?
Amira除了提供基本包模块,还可以提供不同功能性的扩展模块。使用者可以根据研究的需要,挑选适合的模块。

基本包模块(Basic Package)
无论是重构几何还是任何导入的三维数据,包括时间序列, Amira基本包都能提供广泛的可视化技术和交互式操作功能。通过一套综合的三维后处理工具组合,它可以提供了一个高度灵活和强大的三维可视化仿真平台。

支持的平台:
Windows 32-bit, Windows 64-bit, Mac OS, Linux

主要功能:

1.处理和重构
通过各种数字过滤器及交互式编辑器来处理图像;对图像体内的组织和区域进行重构。
*图像过滤
*曲面的生成
*图像选取
*切片对齐校正
*自动和手动配准
*体积和图像取样
*体积裁切
*对体积数据直接编辑
*曲面资料编辑
*数据类型转换
*脚本编辑
*三维多平面重建视图融合
*三维多平面重建视图中自动及手动配准

2.可视化和探索
快速交互式及高质量的可视化技术,通过裁剪和配色能很容易的探索体数据。
*正切面、斜切面及曲线切片
*多分辨率的体渲染及阴影
*曲面渲染
*等值线和等值面
*多色频的图像可视化
*图像融合
*高度场
*正切面投影
*线状结构的可视化追踪
*三维特定区域的选取
*裁切与切割
*时间序列数据可视化
*三维多平面重建查看复杂数据集

3.分析和量化
利用高级的统计工具对体进行面和网格分析。交互的完成对距离、角度、面和体的几何测量。Amira同MATLAB相结合执行模拟和先进的数字分析功能。
*组织材料分析统计
*体和曲面的测量
*二维/三维线性测量及标注
*联合定位分析
*数值运算
*密度测定
*曲面分析
*结合MATLAB引擎
*网络统计

4.展示和教学
创建高质量的基于事件时间轴的交互式立体或非立体演示,并生成动画或视频演示文件。
*动画制作工具
*高质量的演示影片
*影片的生成
*多样化的三维立体演示模型
*支持自动立体演示
*二维和三维动画标注展示

扩展模块
Amira作为一个可配置的解决方案,除了提供基本包模块功能,还能通过选择扩展模块来为3D数据的可视化和分析需求提供最好的架构。扩展模块列表如下:

•显微镜模块(Microscopy Option)
这个模块是专门为显微镜用户所设计的其中包括专门针对显微镜数据和反卷积的特定读入器。允许对来自于任何显微镜的3D图像进行研究, 并可以从显微镜的数据抽取和编辑细丝网络。

•神经模块(Neuro Option)
神经模块为弥散张量成像(Diffusion Tensor Imaging - DTI)实验提供工具,包括张量可视化、定向编码色谱图(DEC)及纤维束成像。此外还支持对MR和CT时间序列数据的大脑血流分析。

•分子模块(Molecular Option)
为可视化分子模型增加了高级工具,将硬件加速体渲染和强大的分子编辑器及特定工具相结合来处理复杂分子的可视化。

•量化模块 (Quantification+ Option)
提供先进的工具来获取和可视化3D图像的高级定量信息。此模块提供了广泛的软件工具用于执行自动分割、卷积、对象分离、精确统计及几何图形信息。

•虚拟现实模块 (VR Option)
将数据的可视化实现了大屏幕显示或沉浸式虚拟现实环境,支持3D导航设备以及快速多线程和分布式渲染。

•骨架化模块 (Skeletonization Option)
增加了一些工具用于重构、分析、神经和血管网络的骨架化显示以及关于诸如分割长度和直径的参数定量化。支持对非常大的图像堆栈的骨架

•网格网络模块 (Mesh Option)
增加了工具用于从分割的图像数据中生成3D有限元(FE)网格。使用标量、矢量及张量场显示模块获得高质量的可视化仿真结果。

•开发模块 (Developer Option)
可以使用C++程序语言来自定义可数据视化、数据处理、文件读写器组件。包括一开发向导帮助快速启动。

•超大型数据模块 (Very Large Data Option)
使用外核数据管理技术支持可视化超出计算机可用内存的图像数据,扩展了许多标准组件如正切、斜切、体渲染和等值面的使用

•多组件分析模块 (Multi-Component Analysis Option)
多组件分析模块为割切在图像堆中不同但类似的组件提供工具,可以协助割切分析流程,包括生成二元的图像,分割群聚的组件,抽取割切最终组件等。此模块提供一个详细并完全的教程,解析所有必选和可选流程步骤。

•DICOM数据模块 (DICOM Option)
免费DICOM数据模块扩展Amira的数据导入导出功能,能提供一个方便而清晰的界面让用户读取和保存DICOM数据,同一时间也可以发送DICOM数据集到远程服务器,此功能在医疗研发环境尤其重要。

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